玉溪市統計局設9個內設機構。

一、辦公室

負責機要、文秘、會務、信息、檔案、保密、安全和信訪工作；負責機關和所屬事業單位的黨群工作；負責機關事務管理和后勤保障工作；負責機構編制、人事管理、教育培訓等工作；負責財務、國有資產管理、政府采購等工作，監督管理下級政府統計部門規范使用中央、省級撥付的統計經費；承辦局領導交辦的其他事項。

二、統計制度法規科（統計執法支隊）

管理全市統計標準，承擔統計體制改革有關工作；審批地方統計調查項目，負責城鄉劃分工作；負責統計法治工作，組織全市統計普法宣傳教育及統計法律法規業務培訓；負責規范性文件起草、審核；組織實施統計執法監督檢查，預防和查處統計違法案件，負責全市統計執法隊伍管理及統計執法業務培訓。

三、國民經濟核算和綜合統計科

組織對全市和各縣（市、區）生產總值進行統一核算，組織投入產出調查，編制自然資源資產負債表；對國民經濟和社會發展狀況、縣域經濟發展情況、城市基本情況進行統計監測；整理、編輯、提供綜合性統計資料；對有關統計數據質量進行檢查和評估；負責統計數據發布；指導有關專業統計基礎工作；進行統計分析。

四、農村社會經濟統計科

組織實施農業普查、農林牧漁業統計、縣域社會經濟基本情況統計；收集、整理和提供有關統計數據；對有關統計數據質量進行檢查和評估；指導有關專業統計基礎工作；進行統計分析。

五、工業統計科

組織實施全市規模以上工業、規模以下工業的抽樣調查、工業戰略性新興產業統計；收集、整理和提供有關的統計數據；對有關統計數據質量進行檢查和評估；指導有關專業統計基礎工作；進行統計分析。

六、能源統計科

組織實施能源生產、消費及銷售統計；收集、整理和提供有關統計數據；組織實施全市及各縣（市、區）能源消費總量及單位GDP能耗核算；組織編制全市及各縣（市、區）能源平衡表；配合相關部門開展碳排放核算相關工作；對有關統計數據質量進行檢查和評估；指導有關專業統計基礎工作；進行統計分析。

七、固定資產投資統計科

組織實施固定資產投資、建筑業、房地產開發業統計；收集、整理和提供有關統計數據；對有關統計數據質量進行檢查和評估；指導有關專業統計基礎工作；進行統計分析。

八、服務業統計科

組織實施批發和零售業、住宿和餐飲業、商品市場運行狀況、交通運輸能源消費以及除批發、零售、住宿、餐飲、房地產開發業以外的服務業、互聯網經濟統計；收集、整理和提供有關統計數據；對有關統計數據質量進行檢查和評估；指導有關專業統計基礎工作；進行統計分析。

九、人口與社會科技統計科

組織實施人口普查、人口抽樣調查、工資統計、研發創新、文化及相關產業統計、人才統計、婦女兒童兩個發展規劃綱要執行情況等統計監測；收集、整理和提供有關統計數據；對有關統計數據質量進行檢查和評估；指導有關專業統計基礎工作，進行統計分析。